殺菌鍋可以通過使用壓縮空氣來對產品進行反壓殺菌。并且當產品需要在設備內進行冷卻時，可以通過使用水泵將冷卻時所使用的冷卻水通過噴水管以及水循環系統來對產品進行降溫。
   反壓殺菌主要是通過使用壓縮空氣來對設備內部的壓力進行增加從而實現反壓殺菌。而壓縮空氣作為一種導熱性較差的氣體。不能在設備進行加熱殺菌的過程之中釋放壓縮空氣，只有在當設備內部達到了能夠殺菌的溫度后再進行保溫的時候才可以釋放出壓縮空氣進行反壓殺菌，通常是對殺菌鍋增加0.5至0.8個大氣壓力。當設備的殺菌結束之后，殺菌鍋內部所存在的溫度變化會不斷的產生降低，并且其內部的蒸汽會出現凝結，而且鍋內的壓力會隨著壓縮空氣的補償而逐漸產生降低。
   殺菌鍋在進行殺菌時需要注意設備在運行時的初始排氣，使得設備內部的蒸汽能夠產生流動。而殺菌鍋需要殺菌的產品能夠造成設備的殺菌溫度、殺菌時間以及殺菌時的壓力等不同。